دخلت ماهينور السجن أكثر من مرة في أكثر من عهد، فقد تكرر احتجازها في عهد مبارك، إلا أنها لم تقضِ ليلة واحدة في زنزانة، أيضاً دخلت السجن في عهد الرئيس محمد مرسي، واحتجزت بسجن برج العرب بتهمة اقتحام قسم شرطة الرمل، وهي الآن تنهي مدة حبس قدرها عامان بتهمة التظاهر دون تصريح، والتعدي على قوات الأمن، وذلك عقب مشاركتها في وقفة تضامنية، بالتزامن مع قتل المتهمين في خالد سعيد، إلا أن ماهينور تقول: "على فكرة تضحياتنا لا تعتبر تضحيات، بالمقارنة بآلام وأوجاع الشعب الفقير".